Η εκπαίδευση στην τουαλέτα μπορεί να είναι μια πρόκληση για τα παιδιά με τυπική ανάπτυξη, αλλά μπορεί να είναι ακόμη πιο δύσκολη για ένα παιδί με αυτισμό ή παρόμοια διαταραχή. Τα παιδιά με αυτές τις διαταραχές μπορεί να έχουν σύνθετες αισθητηριακές διαταραχές, μπορεί να μην ανταποκρίνονται στην κοινωνική αποδοχή και μπορεί να αναπτύξουν γρήγορα μια εξάρτηση από τις ενδείξεις που τα εμποδίζει να ξεκινήσουν ενέργειες από μόνα τους.

Μια πιθανή προσέγγιση για την εκπαίδευση στην τουαλέτα είναι η εντατική εκπαίδευση στην τουαλέτα. Συχνά δοκιμάζεται σε περιπτώσεις όπου διάφορες προσπάθειες εκπαίδευσης του παιδιού στην τουαλέτα έχουν αποτύχει.